我们时常在很多顶刊论文中看到UpSet图，但是往往被它看似复杂的图组结构“难住”！

其实UpSet图就是我们上一期介绍的韦恩图的高级版~这一期关于UpSet图的相关知识，我们依旧从以下几个方面来介绍：定义&用途、具体怎么看（案例分析）、相关疑问&解答（UpSet图和韦恩图的联系与区别、UpSet图和韦恩图的关系示意）

一、定义&用途

定义：UpSet图是一种用于展示不同组之间共有和特有部分的可视化方式，也是韦恩图的另一种替代方式。

用途：

广泛应用于gene组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学等研究领域：

• 展示数据集合之间的交集关系。

• 展示两两比较组间独有的及共有的差异基因数目。

• 展示元素分类亚组或重点关注的交集区域。

二、UpSet图具体怎么看

案例解读：

研究者通过UpSet图显示样品之间共享的脂质种类数量，以及两者所特有的脂质种类，其中南极菌（Nha）含有110种脂质。而深湖菌的纯培养物（HP）始终含有约165种脂质，共培养物在前12小时内（Cc_12）有大约140种脂质，到48小时实验结束时（Cc_48）逐渐增加到约175种。

三、相关疑问&解答

（1）UpSet图和韦恩图有什么样的联系与区别？

UpSet图和韦恩图均可对集合共有和特有元素信息进行可视化，但是当数据分组过多（分组≥5）时，韦恩图看起来会非常杂乱，而UpSet图可以展示更多集合元素的共有和特有信息。

总结：

①分组＜5，韦恩图可以更清晰地展示不同分组之间的交集关系。

②分组≥5，UpSet图可以更清晰地展示多个集合的交集情况。

③韦恩图的可视化数据图结构较为单一，UpSet图的数据展示方式更多元。

（2）UpSet图和韦恩图的关系示意

文章出自：细胞实验外包   想了解更多请关注：http://www.dj-cro.com/